Het doel van de Bonno van der Putten Foundation is het verrichten van activiteiten op het gebied van natuur- en natuurbehoud, kinderen en cultuur, alsmede het steunen van organisaties die zich hiermee bezighouden.
De Foundation zoekt zelf actief naar te ondersteunen initiatieven die aansluiten op de doelstelling. Aanvragen voor financiële ondersteuning kunnen in principe niet worden gehonoreerd. Nadruk ligt op die organisaties en projecten die een goed trackrecord hebben laten zien, vooruitstrevend zijn, en uitzonderlijke kwaliteit hebben bewezen.
De Bonno van der Putten Foundation is een vermogensfonds, en werft niet actief geld of goederen. Ieder winstoogmerk is afwezig. Bestuurders zijn onbezoldigd. De opbrengst van het vermogen wordt uitsluitend aan de doelstellingen besteedt.